猫贾第虫感染可能自我消除，但是应该注意潜在宿主传染。可以使用甲硝唑、阿苯达唑、替硝唑、奎纳克林和呋喃唑酮等药物用于犬猫进行治疗。目前广谱驱虫药--拜宠清连服2-3天，也能够治疗犬猫贾第虫肠炎。 

要注意的是不能给猫空腹喂甲硝唑药物，因为甲硝唑对宠物的胃刺激太大，正确的方法应是和食物一块喂食。甲硝唑驱虫是需要连续吃一个星期以上的，因为甲硝唑特别的苦，在喂的时候一定要夹在食物里面。还要注意给猫咪经常更换猫砂，并且给猫砂盆消毒，猫砂中可能残留大量贾第虫，有可能造成反复发作。